中压紫外线消毒器由一个304或316L不锈钢反应器和在反应器内部成行排列的高能量中压标准3-20千瓦紫外灯组成。

和低压紫外线消毒设备一样，每个紫外线消毒灯管由一个石英套保护。石英套由一个空气驱动的清洗设备自动清洗，清洗周期可调。紫外线消毒灯管由电磁镇流器产生动力。每个反应器均有一个独立的灯泡驱动外壳包含平镇流和其他灯泡供电部件。因其采用模块化部件和高能量中压灯泡的简单设计，使设备维护变得简单。

所有中压紫外线消毒设备反应器的控制功能均置于一个设备控制柜。PLC控制设备运行，并带有一个触屏式操作界面。软件的一个重要功能是控制紫外线消毒过程，监测设备状态并对故障及时报警。此故障保护设备保证了操作人员和设备的安全。

中压紫外线消毒器灭活效率由紫外线灯的光谱输出决定。在隐孢子虫进行灭活的紫外线光谱区中，中压紫外线消毒设备采用高效的中压水银汞灯。每个紫外线消毒灯管均带有一个紫外线传感器。另一个中压紫外线消毒设备的关键技术是石英清洗技术。此设计的一个基础是一个不锈钢刷用于清洗石英表面并防止形成污垢层。 清洗装置由许多不锈钢毛，利用气压缸清洗器可前后活动。清洗器的运动频率可由控制面板上的操作界面调节。

一般来说，紫外线消毒设备设计在流量时紫外线剂量为40 mJ/cm2以保证达到处理目标。隐孢子虫和贾第虫的灭活率与水中的紫外线剂量成正比。紫外线剂量由mJ/cm2 (或 mWs/cm2)表示。独立的微生物实验室证明在老鼠传染实验中小于<10 mJ/cm2  紫外线可提供大于4log(99.99%)隐孢子虫灭活，符合美国EPA/NSF环境技术计划。